Het St. Antonius Ziekenhuis is een opleidingskliniek en heeft de status van Teaching Hospital. De ziekenhuisapothekers zijn daarom betrokken bij de opleiding van diverse zorgverleners. Binnen de afdeling Klinische Farmacie worden de volgende opleidingen verzorgd:
De Klinische Farmacie van het St. Antonius Ziekenhuis heeft een bevoegdheid voor vier opleidingsplaatsen voor ziekenhuisapotheker en opleidingsplaatsen voor klinisch farmacologen, zijnde ziekenhuisapothekers of medisch specialisten.