Op de tweede verdieping neemt de St. Antonius Academie, waar diverse opleidingen en trainingen worden gegeven, een belangrijke plaats in. Daarnaast bevinden zich op deze verdieping:
Belangrijk voor de St. Antonius Academie is dat zij op de nieuwe locatie in het ziekenhuis zelf gevestigd zullen zijn in plaats van in een bedrijfspand buiten het ziekenhuis. De opleiding vindt dus plaats op de plek waar deze uiteindelijk ook in de praktijk zal worden gebracht.