Het specialisme Medische Microbiologie en Immunologie onderzoekt patiëntenmateriaal ten behoeve van preventie, diagnostiek en therapie van infecties en ziekten van het immuunapparaat. Het belang van de patiënt en dienstverlening aan de aanvragers staan centraal in de werkzaamheden. De laboratoria voeren ieder een basisverrichtingenpakket uit.

Bijzondere onderzoeken of onderzoeken die minder vaak voorkomen vinden in principe plaats op één van de locaties. De afdeling Ziekenhuishygiëne en Infectiepreventie in het ziekenhuis wordt gecoördineerd vanuit de afdeling Medische Microbiologie.

De Regionale Maatschap Medische Microbiologie en Immunologie is een samenwerkingsverband van de afdelingen Medische Microbiologie en Immunologie van de ziekenhuizen:

• St. Antonius Ziekenhuis;
• Diakonessenhuis Utrecht, Zeist en Doorn;
• Hofpoort Ziekenhuis Woerden.

Samen vormen de laboratoria van de genoemde afdelingen het Streeklaboratorium voor de Volksgezondheid van de regio Utrecht; zij hebben een functie voor de Openbare Gezondheidszorg (OGZ).